La Nautilus référence 5980/1A-001 est le premier chronographe Nautilus présenté en 2006 pour célébrer le 30e anniversaire de la montre de sport emblématique de Patek. Elle est dotée d'un boîtier en acier inoxydable de 40,5 mm et d'un bracelet assorti intégré. Le cadran est bleu ; un cadran noir et un cadran blanc seraient introduits quelques années plus tard.